甘肅中醫(yī)藥大學設有中醫(yī)臨床學院、藥學院、針灸推拿學院、中西醫(yī)結合學院、第一臨床醫(yī)學院、第二臨床醫(yī)學院、護理學院、基礎醫(yī)學院（敦煌醫(yī)學研究院）、公共衛(wèi)生學院、經(jīng)濟貿易管理學院等學院，以下是具體名單，以供參考，可調整的，以學校最新公告為準。

1、學院設置

中醫(yī)臨床學院

藥學院（西北中藏醫(yī)藥協(xié)同創(chuàng)新中心辦公室）

針灸推拿學院

中西醫(yī)結合學院

第一臨床醫(yī)學院

第二臨床醫(yī)學院

護理學院

基礎醫(yī)學院（敦煌醫(yī)學研究院）

公共衛(wèi)生學院

經(jīng)濟貿易與管理學院

信息工程學院（教育技術中心）

人文與外國語學院（甘肅省中醫(yī)藥文化傳承發(fā)展中心辦公室）

馬克思主義學院

國際教育學院（絲路中醫(yī)藥發(fā)展研究院）

藏醫(yī)學院

體育與健康學院

繼續(xù)教育學院（職業(yè)技能培訓中心）

教學實驗實訓中心

第一附屬醫(yī)院臨床教學部

第一附屬醫(yī)院研究生部

第二附屬醫(yī)院臨床教學部

第二附屬醫(yī)院研究生部

2、甘肅中醫(yī)藥大學簡介

甘肅中醫(yī)藥大學，位于甘肅省蘭州市，是甘肅省人民政府與國家中醫(yī)藥管理局共建的大學，“卓越醫(yī)師（中醫(yī)）教育培養(yǎng)計劃”改革試點院校、獲得中國政府來華留學生獎學金的大學、“5+3”中醫(yī)藥綜合招生學校、“新工科研究與實踐工程”實施高校、甘肅省第四次全國中醫(yī)藥普查試點工作技術支撐單位、甘肅省國家基本藥物所需中藥材種苗繁育基地建設牽頭指導單位、甘肅省地方中藥材標準制定牽頭單位、科技部“慢性病防治中醫(yī)藥示范國際科技合作基地”、甘肅省中藥標準化技術委員會秘書處常務單位、世界中醫(yī)藥學會聯(lián)合會敦煌醫(yī)學研究與文化傳承專業(yè)委員會牽頭單位，具有博士學位授予權。

學校前身為創(chuàng)建于1978年的甘肅中醫(yī)學院；2015年，學校正式更名為甘肅中醫(yī)藥大學。