鄂爾多斯生態(tài)環(huán)境職業(yè)學院設有生態(tài)工程系、生物技術系、機電工程、經濟管理系、市政工程系、基礎部、中等職業(yè)教育處及其他部門，以下是具體名單，以供參考，可調整的，以學校最新公告為準。

一、學院

生態(tài)工程系

生物技術系

機電工程

經濟管理系

市政工程系

基礎部

中等職業(yè)教育系

二、鄂爾多斯生態(tài)環(huán)境職業(yè)學院簡介

經內蒙古自治區(qū)人民政府批準成立鄂爾多斯生態(tài)環(huán)境職業(yè)學院、鄂爾多斯市政府投資建設、在鄂爾多斯農牧學校基礎上組建的一所高職院校，學院培育生態(tài)建設、環(huán)保應用型人才是專業(yè)設置關鍵，本地化、面向西、服務全區(qū)，逐步建成以高等職業(yè)教育為主體的體系、中等職業(yè)教育作為補充、以成人函授和培訓為補充的多元化辦學體系。

鄂爾多斯生態(tài)環(huán)境職業(yè)學院的前身是1978年在大拉特旗成立的鄂爾多斯農牧學校，2011年，更名為鄂爾多斯生態(tài)環(huán)境職業(yè)學院。